不用传统DNA,准确率高达95%,新活检方法用RNA识别早期癌症

美国芝加哥大学团队开发了一种更为灵敏的液体活检技术,该方法利用RNA而不是传统的DNA来检测癌症。这一创新方法在使用患者血液样本进行测试时,识别出早期结直肠癌的准确率达到95%,显著优于现有的非侵入性检测手段。这项研究发表于最新一期《自然·生物技术》杂志。

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当肿瘤细胞死亡并分解时,它们会将遗传物质释放到血液中。目前的标准液体活检技术主要依赖于这些漂浮的DNA片段,即循环游离DNAcfDNA),来进行癌症检测。然而,在疾病早期阶段,由于肿瘤细胞仍在快速增殖,血液中的cfDNA含量往往较少,这限制了早期诊断的准确性。

与之不同的是,分析RNA可以提供关于基因活动的重要线索,因为RNA的存在,表明细胞正在积极地工作和构建蛋白质。

此次团队探索了使用循环游离RNAcfRNA)而非cfDNA的可能性。通过对结直肠癌患者的样本进行分析,团队不仅检测出人类细胞cfRNA的修饰情况,还发现了肠道微生物群落产生的RNA。人体消化系统内居住着数十亿计的细菌,随着癌性肿瘤的发展,这些微生物的行为也会发生变化。研究表明,RNA修饰水平能够反映生物体的状态:越活跃的生物体,某些RNA的修饰就越频繁。同样模式也在结直肠癌样本中得到了验证。

进一步的研究揭示,癌症患者与健康个体之间,由微生物释放的RNA存在显著差异。随着肿瘤增长,其周围的微生物群落必须适应炎症环境,导致微生物群落更新速度加快,更多的细胞死亡并将RNA片段释放到血液中。这意味着,基于微生物RNA修饰水平的检测可能比依赖人类肿瘤细胞释放DNA的方法更早发现潜在的癌症迹象。

市面上现有检测粪便中DNARNA丰度的测试方法,检测晚期癌症的准确率约为90%,但检测早期癌症的准确率则降至50%以下。相比之下,基于RNA修饰的新方法总体准确率接近95%,并且对早期癌症同样有效。

本文采编:CY
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